هیات رهبری دانشگاه بنابر لزوم دید تربیه‌ی دیپلومات‌ها، سیاست‌ورزان و سیاست‌گذاران ورزیده در کشور، ماستری تخصصی روابط بین الملل را در سال ۱۳۹۲ آغاز کرده است. از آن‌جا که دیگر دانشگاه‌ها ماستری روابط بین‌الملل را به‌گونه‌ی تخصصی تدریس نمی‌کنند، دانشگاه افغانستان ماستری تخصصی را یگانه راهکار برای تربیت نسل متعهد، فهمیده و سیاست‌ورز دانست و از این‌رو، مفردات درسی این رشته را به گونه‌ی معیاری تدوین و برای تدریس تصویب کرد. تا اکنون دانشگاه افغانستان بیش از ۱۰۰ متخصص تحلیل‌گر، سیاست‌گذار در عرصه‌ی بین‌المللی و سیاست خارجی به کشور عزیز پیشکش کرده است.